Hoitokunta ohjaa Saaristomeren Suojelurahaston toimintaa ja tekee
esitykset Centrum Balticum -säätiön hallitukselle rahoitettavista hankkeista.
Puheenjohtaja: Ympäristönsuojelupäällikkö Olli-Pekka Mäki, Turun kaupunki
| Jari Hänninen, apulaisprofessori, Turun yliopisto |
| Varajäsen: Katja Mäkinen, tutkijatohtori |
| Timo Juvonen, erikoissuunnittelija, Varsinais-Suomen liitto |
| Varajäsen: Heikki Saarento, suunnittelujohtaja |
| Sanna Kipinä, ylitarkastaja, Varsinais-Suomen ELY-keskus |
| Varajäsen: Pekka Paavilainen, ylitarkastaja |
| Hannu Klemola, aluepäällikkö, Suomen luonnonsuojeluliiton Varsinais-Suomen piiri ry |
| Varajäsen: Sanna Tikander |
| Piia Leskinen, yliopettaja , Turun ammattikorkeakoulu |
| Paavo Myllymäki, toiminnanjohtaja, MTK-Varsinais-Suomi |
| Varajäsen: Aino Launto-Tiuttu, agronomi |
| Olli-Pekka Mäki, ympäristönsuojelupäälikkö, Turun kaupunki |
| Varajäsen: Liisa Vainio, ympäristönsuojelusuunnittelija |
| Martin Snickars, yliopistonlehtori, Åbo Akademi |
| Varajäsen: Mikael von Numers, yliopisto-opettaja |